Цикл 3-міс. спеціалізації (468 годин) зі спеціальності “Бактеріологія” проводиться з метою набуття спеціальних знань та професійних практичних навичок і вмінь, які необхідні для практичної діяльності  бактеріологам. Цей цикл призначений  для лікарів, які закінчили інтернатуру за однією із лікарських спеціальностей, крім спеціальностей «Лабораторна діагностика, вірусологія, мікробіологія», «Мікробіологія і вірусологія», а також спеціальностей стоматологічного та медико-психологічного; для осіб, які здобули вищу освіту другого (магістерського) рівня за спеціальністю "Біологія та біохімія" або "Біологія";і для лікарів-бактеріологів та бактеріологів, які не працювали більше трьох років за цією спеціальністю .

Цей цикл є актуальним в зв’язку зі збільшенням росту інфекційних захворювань та необхідності ідентифікувати збудників, для підбору найбільш оптимальних методів впливу на патогенні мікроорганізми, особливо в умовах зросту спектру антибіотикорезистентних штамів.

Програма складається з 12 основних курсів та включає усі розділи, які відповідають вимогам освітньо-кваліфікаційної характеристики спеціаліста зі спеціальності «Бактеріологія». У програмі знайшли відображення усі напрямки практичної роботи бактеріолога. Основну частину програми присвячено принципам та підходам по ідентифікації та аналізу мікроорганізмів. Крім того, в програму включено цілий блок додаткових програм із суміжних дисциплін (68 годин).